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문의사항

RNA-Seq star2_index 질문
  • 유형 이용문의
  • 상태답변완료
  • 작성자 r*********
  • 작성일2024-11-29 10:36:35
  • 조회수59

안녕하세요, RNA-SEQ 공개 파이프라인을 사용하여 프로그램을 돌리던 와중 Star2_index에서 genomeSAindexNbases14로 설정이 되어있는 것을 11로 바꾸어 돌려야할 것 같은데 공개 파이프라인이라 스크립트 수정이 안되어 연락드렸습니다. 해결 방법이 있을까요? 해당 로그 파일은 job_scripts/4031179 였습니다. 

 

!!!!! WARNING: --genomeSAindexNbases 14 is too large for the genome size=22948289, which may cause seg-fault at the mapping step. Re-run genome generation with recommended --genomeSAindexNbases 11

  • #문의

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답변

안녕하세요 바이오 익스프레스 개발팀입니다.

 

사용중에 불편함을 느끼게 해드린 점 양해 구합니다.

 

문의해주신 내용은 Star index 생성 프로그램에 genomeSAindexNbases 옵션을 추가로 입력할 수 있게 수정하겠습니다.

 

작업이 완료되면 등록되어 있는 메일로 연락드리겠습니다.

 

감사합니다.

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