안녕하세요, 

RNA-Seq을 돌리며 STAR2 프로그램을 돌리면 output으로 나오는 Bam 파일의 사이즈가 계속 0 byte라 질문드립니다...

STAR2를 돌리기 위한 선행 과정인 index 부분에서의 input 문제인지 확인하기 위해 Ensemble에서 human GTF 파일과 reference sequence에 human GRCh38.dna.primary_assembly 파일을 사용해보고 GRCh38.toplevel도 사용해보았지만 GRch38.primary를 사용하였을 때 index 파일이 잘 생성되는 것을 확인하여 index 과정에는 문제가 없다고 판단하였습니다. 

Raw data의 문제인지 확인하기 위해 FastQC를 돌렸을 때 FastQC의 결과값 또한 잘 나와서 raw data의 문제도 아닌 것 같은데 STAR2를 돌릴때마다 output의 Bam 파일의 사이즈가 0 byte로 나왔습니다. 

혹시 이 과정에서 어떤 문제점이 더 있을 수 있는지 알고 싶어 문의드리게 되었습니다. 

돌린 스크립트의 category number는 4101598이었습니다!!!

감사합니다.